瑤海區(qū)檔案館保存有50個(gè)全宗，均為中華人民共和國成立后檔案，館藏檔案40萬余卷件，其中民生檔案32萬余卷件，主要來源于瑤海區(qū)委、區(qū)人大、區(qū)政府、區(qū)政協(xié)、區(qū)屬有關(guān)單位移交的檔案和資料。主要門類有文書檔案、婚姻檔案、醫(yī)學(xué)出生證明檔案、工傷認(rèn)定檔案、勞動(dòng)仲裁檔案、城鄉(xiāng)居保檔案、退役軍人檔案、會計(jì)憑證檔案、疫情防控檔案、審計(jì)檔案等。

瑤海區(qū)檔案館的館藏檔案承載了地區(qū)的發(fā)展歷史，是編史修志、工作查考、資政議政、科學(xué)研究及進(jìn)行愛國主義教育的重要史料，是經(jīng)驗(yàn)得以總結(jié)、規(guī)律得以認(rèn)識、歷史得以延續(xù)、各項(xiàng)事業(yè)得以發(fā)展的重要資源。